Là đơn vị góp phần quan trọng vào bề dày lịch sử và sự phát triển của trường Đại học Thương mại. Viện Quản trị kinh doanh được thành lập năm 1960 (tiền thân là ban kinh tế thương nghiệp) với sứ mệnh đào tạo và bồi dưỡng cán bộ trung và cao cấp cho ngành nội thương.

Năm 1994, khoa Quản trị doanh nghiệp được thành lập với mục tiêu đào tạo các nhà quản trị doanh nghiệp phụng sự nhu cầu phát triển kinh tế xã hội của nước nhà.

Năm 2010, đứng trước những thay đổi về nhu cầu đào tạo, nhằm đáp ứng nhu cầu nguồn nhân lực cho phát triển kinh tế xã hội trường đại học Thương mại đã tái cơ cấu khoa Quản trị doanh nghiệp thương mại thành hai đơn vị: khoa Quản trị doanh nghiệp và khoa Quản trị kinh doanh.

Năm 2016, khoa Quản trị doanh nghiệp chính thức được đổi tên thành khoa Quản trị kinh doanh, được nhiệm vụ quản lý và tổ chức thực hiện các chương trình đào tạo gồm: 03 chương trình đào tạo ở trình độ Đại học (Quản trị kinh doanh - Chương trình chuẩn; Quản trị kinh doanh - Chương trình chất lượng cao và Khởi nghiệp và phát triển kinh doanh); 02 chương trình đào tạo thạc sĩ (Chuyên ngành quản trị kinh doanh) và 01 chương trình đào tạo tiến sĩ (Ngành Quản trị kinh doanh).

Ngày 3/10/2023 Hội đồng trường Đại học Thương mại đã thông qua nghị quyết thành lập Viện Quản trị kinh doanh. Đây là một cột mốc quan trọng cho sự phát triển của Viện Quản trị kinh doanh, mở ra một chặng đường phát triển mới. Hành trình mới, hành trình thực hiện sứ mệnh kiến tạo nên những thế hệ nhà quản trị tài năng cho sự phát triển của xã hội. Một hành trình đầy thách thức, nhưng với truyền thống vẻ vang của khoa Quản trị kinh doanh là tài sản quý báu được viết lên bằng công sức trí tuệ của lớp lớp thế hệ đi trước Viện Quản trị kinh doanh hôm nay vinh dự được viết tiếp những trang sử vẻ vang kết nối sợi dây của lịch sử gắn kết quá khứ tốt đẹp Viện Quản trị kinh doanh đã sẵn sàng cho những sự khác biệt phía trước.